隨著人們生活水平的提高，對健康的要求越來越高，益生菌普遍的被接受并廣泛使用。益生菌是一類對宿主有益的活性微生物，是定植于人體腸道、生殖系統內，能產生確切健康功效從而改善宿主微生態平衡、發揮有益作用的活性有益微生物的總稱。
2001年3月中國衛生部發布了衛法監發〔2001〕84號,益生菌類保健食品評審規定第十條明確指出：不提倡以液態形式生產益生菌類保健食品活菌產品，因益生菌已經過科學實驗認證液態存活非常難,且益生菌怕水,所以消費者在購買益生菌的時候一定要選擇冷藏運輸,或者在超市冰柜冷藏柜中的益生菌粉狀，而其他一些液態飲料以及網絡銷售的無冷藏運送的產品益生菌存活非常低。
因此益生菌凍干法是保存益生菌的一個好的解決方法，解決了益生菌活菌易死亡，菌數不穩定，益生菌產品保質期短，質量不穩定的技術問題。冷凍干燥在低溫下進行升華和解析干燥，因此對于益生菌這類熱敏性的物質特別適用。冷凍干燥過程中給采用的是低溫凝固，低溫升華干燥除水和低溫解析的方法除結合水，因此冷凍干燥后的益生菌凍干粉疏松多孔，呈海綿狀，溶解迅速而*，幾乎立即恢復原來的性狀。冷凍干燥在真空下進行，氧氣極少，益生菌活性能夠得到充分保護。冷凍干燥能排除95-99%以上的水份，干燥后的益生菌產品能長期保存而不致失活、變質。
益生菌凍干最主要的是益生菌配方保護劑的篩選和凍干工藝曲線的設置。只有合適的配方和合適的工藝曲線才能保證凍干出來的樣品外觀好，活性高。不然工藝控制不合適可能凍干后活菌的活性已經失活了。益生菌凍干機選擇要選擇硅油循環型凍干機，選擇原位凍干機，避免轉移污染和影響樣品。硅油循環凍干機能夠有效精確控制板層溫度，溫度均一性好，板層溫度可調、可控制不同的溫度，干燥過程升降溫速率可控，可以設置不同的凍干工藝曲線，實現樣品的成功凍干；同時可以采用手動模式模式工藝，自動控制模式進行成熟工藝生產；可以配置干燥室真空調節功能，方便進行真空調節控制溫度，提高升華干燥效率。選擇益生菌用凍干機可以選擇Pilot E\M\ES\EP等系列凍干機。
